| El Palmar Club de Fútbol | Tercera División de España | — | 2006 | — |
 Elche Club de Fútbol | Primera División de España | — | 1923 | Estadio Manuel Martínez Valero |
| Elche Club de Fútbol Ilicitano | Segunda División B de España | — | 1932 | — |
| ElPozo Ciudad de Murcia | Liga Nacional de Fútbol Sala | — | 1992 | Palacio de Deportes de Murcia |
| EMF C.D.Cobeña | — | Cobeña | 1998 | — |
| Erizana Club de Fútbol | — | Bayona | 1950 | — |
 Escocés Fútbol Club | — | Barcelona | enero 1900 | Velódromo de la Bonanova |
| Escuela de Fútbol Dolorense | — | Los Dolores (Cartagena) | 1905 | — |
| Escuela de Iniciación San Martín del Rey Aurelio | Tercera División de España | — | 2012 | — |
| Escuela Municipal y Deportiva Santillana | Regional Preferente de Cantabria | — | 2004 | — |
 Esport Club Granollers | Primera Catalana | — | 1913 | — |
| Estrella Club de Fútbol | Interinsular Primera | Santa Lucía de Tirajana | 1946 | — |
| Extremadura Femenino Club de Fútbol | Tercera Federación Femenina | Almendralejo | 1995 | Estadio Francisco de la Hera |
 Extremadura Unión Deportiva | Segunda División de España | Almendralejo | 2007 | Estadio Francisco de la Hera |
| Écija Balompié | Tercera División de España | Écija | 1939 | Estadio San Pablo |